日本トイザらス（株）は、平成18年1月期決算短信（連結）の会社の対処すべき課題で、物流の効率的運営を追求するため、次期物流とシステムの開発を行ない、複数業態への対応と在庫回転率の向上に努めるとしている。
また、インターネットショッピングサイトは、仕入購買業務、在庫管理、物流その他の管理業務を一元化することにより、グループ全体の資産効率と業務効率の改善が図れることから、100％子会社であるトイザらス・ドット・コムジャパン（株）を2006年4月1日付で吸収合併する。
このことにより、組織面での連携ならびに販売促進活動の連携を深め、クリック・アンド・モルタル（インターネットと店舗網）の相乗効果をより一層発揮し、最大限の効率化を図る。
経営成績では、インフラ面で、新設した「札幌デポ」の本格稼動により、市川、神戸とあわせて三つの物流拠点網を構築し、着実な出店と確実な商品供給を維持し、日々増加する物流に対処するとともに、物流のさらなる円滑化に努めた。
