日本生活協同組合連合会は「環境報告書2006」を公表し、物流部門のCO2排出量が、2002年度比で6.6％増加しており、一方で、物流部門の按分方法の妥当性を検証し、ＣＯ2排出量を日本生協連分と会員生協分に正確に切り分ける事が困難であり、今後、物流部門の業務内容が変化していく中では、さらに困難な事がわかった。
そのため、2006～2008年度計画は、日本生協連（オフィス部門）と物流部門は合算しないで、それぞれの計画を管理する事とした。
2006～2008年度計画では、物流部門（ＣＸカーゴ）については、新たな集品ラインや冷凍施設の稼動によりCO2の増加が見込まれるため、供給商品1点あたりＣＯ2を、2002年度比で2008年度に6％削減する。
