日本貨物鉄道（JR貨物）は5月13日、新型コロナウイルスによる輸送への影響について発表した。
現在までのコンテナ輸送の動向については、4月の輸送量がコンテナで対前年89.0％、車扱で91.6％（ともに災害補正・同曜日配列補正後の比較）と、ほとんどの品目で対前年を下回っており、5月についても傾向に大きな変化はないと見込んでいる。
一方で、今後については、さらなる影響の拡大・長期化による経済の減速に伴い、大幅な減少を懸念している。
運行状況については、一部列車を需要減に伴い運休中。緊急物資の輸送については、要請を受けた際、最優先するとしている。
