国土交通省は9月13日、新たに国土交通省本省職員6名（1395～1400例目）の新型コロナウイルス感染が確認されたと発表した。
＜国土交通省本省職員6名（1395～1400例目）＞
| 所属例目 | 所属 | 勤務場所 | 性別 | 年代 | 居住地 | 最終出勤日 | PCR等検査日 | 判明日 | 症状 | 家族等の感染 |
| 1395 | 大臣官房 | 中央合同庁舎３館 | 男性 | 40代 | 千葉県 | 9月7日 | 9月9日 | 9月9日 | あり | |
| 1396 | 航空局 | 大阪府池田市 | 男性 | 40代 | 大阪府 | 9月10日 | 9月12日 | 9月12日 | あり | あり |
| 1397 | 大臣官房 | 中央合同庁舎３館 | 男性 | 30代 | 東京都 | 9月8日 | 9月12日 | 9月12日 | あり | |
| 1398 | 総合政策局 | 中央合同庁舎３館 | 男性 | 30代 | 東京都 | 9月8日 | － | 9月10日 | あり | あり |
| 1399 | 水管理・国土保局 | 中央合同庁舎３館 | 男性 | 30代 | 東京都 | 9月12日 | 9月13日 | 9月13日 | あり | あり |
| 1400 | 水管理・国土保局 | 中央合同庁舎３館 | 男性 | 50代 | 東京都 | 9月9日 | 9月10日 | 9月10日 | なし | あり |
