日本貨物鉄道が5月10日に発表した2013年3月期決算は、売上高1499億200万円（前年同期比2.0％減）、営業利益37億4900万円（2.7％増）、経常利益4億5100万円（2.8倍）、当期利益4億4700万円（前期は5億5500万円の損失）だった。
鉄道貨物輸送量は、コンテナ貨物においては紙・パルプ、エコ関連物資など東日本大震災からの復旧・復興に伴うものをはじめ、ほぼすべての品目で前期を上回り2051万トン（4.6％増）、車扱貨物は石油の減少等により947万トン（7.3％減）となり、輸送量全体では前期を上回った。
鉄道事業における売上高は1312億円（1.4％減）、営業損失78億円（前期比6億円増）だった。
来期は、売上高1526億円（1.8％増）、営業利益68億円（81.4％増）、経常利益34億円（7.5倍）、当期利益20億円（4.4倍）を見込んでいる。
